El Secretario de Misión es el equipo responsable de animar a las diversas obras Maristas del Perú en la consecución de la Misión del Sector. Está liderado por el Secretario Ejecutivo de Misión quien operativiza las funciones específicas del Delegado de Misión liderando a los coordinadores de los equipos de Educación, Espiritualidad y Laicado y Pastoral-Solidaridad para juntos, facilitar los objetivos del Plan Estratégico del Sector 2019-2023 del cual es responsable.